Hernâni Gonçalves é investigador principal do SPA, grupo de investigação do CINTESIS.
Fez Licenciatura em Matemática Aplicada à Tecnologia, Mestrado em Métodos Computacionais em Ciências e Engenharia e Doutoramento em Engenharia Geográfica na Universidade do Porto.
Foi bolseiro de investigação no projeto CARDIOCRONOS, financiado pela FCT, tendo desenvolvido trabalho na área de processamento de sinal e análise de dados, investigador do Centro de Investigação em Ciências Geo-espaciais da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (FCUP) e Professor Adjunto Convidado do Instituto Superior de Engenharia do Porto (ISEP).
É Professor Auxiliar Convidado da Faculdade de Medicina da Universidade do Porto, no Departamento de Medicina da Comunidade, Informação e Decisão em Saúde (MEDCIDS).